API Reference

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• liom_toolkit
  • liom_toolkit.conversion
    • liom_toolkit.conversion.conversion
  • liom_toolkit.registration
    • liom_toolkit.registration.register
    • liom_toolkit.registration.templating
  • liom_toolkit.scripts
    • liom_toolkit.scripts.liom_align_annotations
    • liom_toolkit.scripts.liom_build_template
    • liom_toolkit.scripts.liom_compute_slice_metrics
    • liom_toolkit.scripts.liom_convert_hdf5_to_zarr
    • liom_toolkit.scripts.liom_create_mask
    • liom_toolkit.scripts.liom_segment_2d
    • liom_toolkit.scripts.liom_train_model
  • liom_toolkit.segmentation
    • liom_toolkit.segmentation.plane_segmentation
    • liom_toolkit.segmentation.stats
    • liom_toolkit.segmentation.volume_segmentation
    • liom_toolkit.segmentation.vseg
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.cldice
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.dataset
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.loss
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.model
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.prediction
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.training
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.utils
      • liom_toolkit.segmentation.vseg.validation
  • liom_toolkit.utils
    • liom_toolkit.utils.allen_sdk
    • liom_toolkit.utils.ants
    • liom_toolkit.utils.checkpoint
    • liom_toolkit.utils.dask_client
    • liom_toolkit.utils.io
    • liom_toolkit.utils.utils
    • liom_toolkit.utils.zarr_writer
  • liom_toolkit.visualization
    • liom_toolkit.visualization.slice_extraction

[1]

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